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尽管在二零零五年，苏丹南北部签署了和平条约，结束了超过二十年的内战，南苏丹地区仍然有庞大的医疗需要。疾病爆发与暴力冲突持续，许多人仍然不能获得基本的医疗护理，导致了不少本来可以避免的死亡。

然而在南苏丹，人民对人道救援的急切需求仍未得到充分的正视，数以千计的流离失所者返回家园，他们依赖原已紧绌的资源生活，令情况更仍恶化。更糟的是，对付紧急情况的国际援助正逐步减少，因为他们把工作重新聚焦在重建与发展项目上。这些虽然是必须的，但却不能反映人民现时生活的实际需要。

无国界医生自一九八三年开始在南苏丹工作，现时是其中一个少数可以留在当地的组织，为极需要援助的人民提供医疗服务。