在阿富汗人们很难获得医疗服务，即使政权沦陷带来了不确定性，我们仍然致力在当地满足人们的健康需求。 无国界医生于阿富汗的工作专注于应对紧急情况及支持儿科和孕产妇，因为阿富汗是世界上孕产妇死亡率最高的国家之一。
无国界医生在阿富汗设有一系列项目，以支持数十年冲突和政治动荡造成的庞大医疗需求，尤其是妇女和儿童的医疗需求。
组织与公共卫生部合作，在赫尔曼德省（Helmand）的一间医院开展工作。 我们也在霍斯特（Khost） 省开设了一间妇产科医院，在坎大哈（Kandahar）开设了一个耐药结核病项目，并在昆都士（Kunduz）开设了创伤中心。 而在赫拉特（Herat）我们治疗营养不良的流离失所儿童。
近年来，无国界医生医院受到数次大型针对性攻击： 2015年10月，美国空袭摧毁了我们位于昆都士的创伤中心，造成42人死亡; 2020年5月，一个武装团组织袭击了我们位于喀布尔（Kabul）达什特巴尔切（Dasht-e-Barchi）医院的妇产科翼，杀死16名母亲和一名无国界医生助产士。 袭击发生后，我们做出了从医院撤离的艰难决定，令该地区的妇女再无法获得急需的紧急产科护理。
2021年8月，阿富汗伊斯兰酋长国（即塔利班）随着政府倒台进入喀布尔市。 无国界医生团队继续在当地提供医疗护理。
