自乌干达于2022年9月20日宣布埃博拉疫情爆发以来，无国界医生一直与该国卫生部合作，支持当地的医疗护理。
截至10月23日，当地已有90宗埃博拉确诊个案，并呈报有28人染疫身亡，另有32人康复并已从治疗中心出院。
鉴于要面对因目前未有针对埃博拉病毒苏丹病毒株的获批疫苗或治疗方法所带来的挑战，并根据以往疫症爆发的经验，无国界医生的应对集中在三个范畴。由医生、护士、后勤人员、感染预防和控制专家和健康推广员组成的团队，现正在努力遏止疫情进一步传播、降低死亡率，并协助流行病学监测、研究和创新。
外展项目统筹姆拜（Denis K. MBAE）解释：“控制埃博拉疫情传播的最重要目标之一，是缩短疾病的初期病征和治疗之间的时间。我们知道，病人越早接受治疗，生存机会越高，而疾病在社区内传播的风险亦越小。”
在疫情中心的穆本德（Mubende）区，目前无国界医生派出数支队伍到靠近病人的地方。例如，他们部分队员到访埃博拉病人曾身处的医疗中心或学校，以支持感染预防和控制，或提供健康宣传建议。
团队亦向那些被迫隔离21天的埃博拉病人接触者提供医疗和社交援助，包括分发卫生用品、食品捐赠和通讯设备等基本必需品。这种支持旨在补助经济活动上的损失，并允许接触者在可接受条件下进行自我隔离。
无国界医生的健康推广员也会负责识别和监测接触者，以迅速发现那些带有疾病风险人士，并提高他们对预防疾病和出现症状时该如何处理的意识。最后，我们正准备支持受影响的健康中心，协助在受疫情影响地区提供免费的基层医疗护理。
与此同时，组织继续协助乌干达卫生部，为仍是疫情中心的穆本德区的病人提供医疗护理。一间设有40张病床的埃博拉治疗中心已经建成，另一间同样设有40张病床、可提供深切治疗护理的设施也正在穆本德镇兴建。而位于玛杜杜（Madudu）的一间设有8张病床的治疗中心现已运作中，主要治疗早期病人。
无国界医生在穆本德的项目统筹巴斯德万（Denis BASDEVANT）说：“除建造这些治疗中心外，我们还捐赠药物和防护设备，并为在医疗设施工作的医护人员提供培训，尤其是关于如何护理病人和实行哪些的卫生措施，这对防止院内感染至关重要。我们亦向卫生部提供组织在管理出血热个案方面有经验的医生和护士等救援人员。”
在该国首都坎帕拉（Kampala），无国界医生将制定类似措施，包括健康推广活动、接触者的社交支持、各卫生设施在预防和感染控制方面的支持，以及与埃博拉无关的医疗护理支持。无国界医生也预期在不久将来参与病人护理。
最后在流行病学方面，传染病研究中心正与卫生部合作，支持流行病学活动，包括监测、感染控制和预防。
无国界医生表示有兴趣并能参与将在未来几周开始、针对埃博拉苏丹病毒株疫苗和治疗的研究。无国界医生疫苗和流行病应对专家约翰逊（John Johnson）说：“那些获批针对2018至2019年间在刚果民主共和国爆发的埃博拉扎伊尔病毒株的有效疫苗和治疗方法，以及随后疫情爆发的管理，是控制病毒传播的关键工具。虽然我们知道这些工具可以提前开发和测试以确定其安全性，但却只能在疫情期间测试其效用。因此，正如2019年在刚果民主共和国进行的扎伊尔病毒株疫苗和治疗的临床试验一样，无国界医生准备大量投资于有关研究。”
