自二零零五年年底，中非共和国政府军与多个叛军组织于该国北部爆发战事，引致大批居民流离失所。于西北部地区，村落遭受袭击、被抢掠或焚毁，迫使居民逃难到邻近不宜居住的森林，他们遭受严重限制，得不到医疗服务，而平民也往往成为公路土匪袭击的受害者。

二零零七年，无国界医生于西北部的卡博（Kabo）、巴坦加福（Batangafo）、帕瓦（Paoua）、卡加班多罗（Kaga Bandoro）、马尔昆达（Markounda）及布圭拿（Boguila）一带，和东北部的比劳（Birao）及戈尔迪勒（Gordil），支持当地的医疗架构，提供基本及中层医疗服务。于今年首八个月，无国界医生便进行了超过十万宗诊症，并为数万名居民（当中大部分为五岁以下儿童），医治疟疾及其它与环境卫生有关的传染病。

频繁的骚扰及不安全环境，经常迫使无国界医生临时暂停流动诊所服务，有时服务暂停更长达八星期，导致病人得不到任何医疗服务。今年六月，无国界医生志愿人员莎法斯（Elsa Serfass）被叛军枪杀，导致无国界医生于好一段时间里，都要减少在中非共和国西北部的救援工作。

三万名居民亦因西北部的暴力冲突，被迫逃到邻国喀麦隆（Cameroon），在缺乏栖身之所、粮食和医療服务的困境下过活。这一年里，无国界医生发现这批难民当中，儿童患上营养不良的问题十分严重后，随即展开营养治疗项目。无国界医生诊治营养不良儿童外，又分发补充营养食品。此外，超过四万五千名中非共和国难民亦于乍得（Chad）南部聚集，无国界医生遂于当地的地区医院工作，为营地的难民及当地居民提供援助。

至于在中非共和国东北部瓦卡加省（Vakaga）的部分地区，约有四万五千人居住，但叛军与政府部队之间的暴力冲突，迫使居民逃离遭战火摧毁的家园。不少人躲藏在邻近的森林里。该地区近乎完全没有医疗服务，无国界医生于是在比劳（Birao）及戈尔迪勒（Gordil）设立流动及固定诊所，为受围困的居民提供医疗服务。