代内尔（Daynille）于十月二十日爆发激烈打斗后，无国界医生被迫停止在摩加迪沙（Mogadishu）外围地区进行的麻疹疫苗注射项目。该项目原本计划在三周内，为三万五千名儿童进行疫苗注射。麻疹疫情正在索马里肆虐。在过去两个月，已经有六万人接受麻疹疫苗注射。

無國界醫生索馬里項目总管麥連（Duncan McLEAN）說：「麻疹──加上营养不良的影响──已经成为索马里儿童的头号杀手。」他续说：「只有进行疫苗注射，才可阻止疫情扩散。」

在项目开展后的首五天，有四千八百三十一名年龄介乎六个月至十五岁的儿童，在代内尔的各个地区接受疫苗注射。但在非洲聯盟駐索馬里特派團（AMISOM）支持的过渡联邦政府和青年党爆发冲突后，令项目被迫停止。

麦连说：「如果局势未能稳定下来，我们将无法重新开展疫苗注射项目。若情况持续，我们必须重新考虑我们的策略，因为不少人已经逃离发生冲突的地区。数以万计流离失所者在代内尔的营地栖身，当中很多人已栖身了一段很长的时间，亦有一些刚抵达的人民是来自受干旱所影响的地区。」

另外，不少人在冲突期间受伤。在十月二十日及二十一日，无国界医生在代内尔医院的医疗队接收了八十三名伤者，他们是受了枪伤或在爆炸中受伤。当中四十一人需要留医，十一人则接受外科手术。

无国界医生自二零零七年八月起，在代内尔的医院支持紧急事故管理。自今年四月开始，无国界医生亦支持严重营养不良的治疗项目。在冲突爆发前，原本有二十四名营养不良儿童正接受深切治疗。但大部分受惊的母亲选择带走孩子，现在只剩下六人仍然接受护理。

无国界医生继续在代内尔医院和摩加迪沙工作，医疗队为流离失所者提供医疗和营养方面的援助。

無國界醫生自一九九一年起一直在索馬里工作，目前在该国有十三个医疗项目，包括为目前的紧急情况所开展的医疗项目、疫苗注射和营养治疗项目。无国界医生于二零零九年恢复在肯尼亚达达阿布（Dadaab）的工作，同时亦在埃塞俄比亚的多洛阿多（Dolo Ado）难民营为索马里难民提供协助。